RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 A0A0B4J2A0 478 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 CENPXA8MT69 81 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 PPP5D1E7EU14 171 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 K7EIM0 57 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 BMPR1BO00238 502 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 LYRM1O43325 122 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR2C1O95371 312 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 DHFRP00374 187 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 IFNA17P01571 189 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLEC3BP05452 202 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 LGI3Q8N145 548 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 LRTM2Q8N967 370 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR52E5Q8NH55 327 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 CACNG5Q9UF02 275 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-202ENST00000540486 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 HSPG2P98160 4391 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 C9orf170A2RU37 121 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 I3L2K1 104 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 PITX3O75364 302 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 TCRBP04435 133 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR4E1P0C645 316 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ANXA3P12429 323 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZP3P21754 424 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SYNJ2BPP57105 145 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPCS3P61009 180 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF846Q147U1 533 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 MLANAQ16655 118 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF114Q8NC26 417 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR1P1Q8NH06 330 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 THYN1Q9P016 225 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 DNAH2Q9P225 4427 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 UPK1BO75841 260 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 NXPH3O95157 252 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 CSN3P07498 182 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 EDN2P20800 178 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 RPEL1Q2QD12 228 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 BSXQ3C1V8 233 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPHB5Q86YW7 130 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 CXorf58Q96LI9 332 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 A0A1B0GU03 582 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 MPTX1A8MV57 137 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ADAP1O75689 374 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGHV3-48P01763 117 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 CTSGP08311 255 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 HOXB5P09067 269 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARL3P36405 182 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SRPXP78539 464 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 DHRS2Q13268 280 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMCO1Q147U7 214 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 LYG2Q86SG7 212 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 LGALS9O00182 355 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 MT-CO2P00403 227 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC25A6P12236 298 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPR183P32249 361 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-202ENST00000540486 SNCAP37840 140 aa6.61□□□□□ -1.35
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