RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM50AO95807 157 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 MEOX1P50221 254 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 SYT8Q8NBV8 401 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 PROK2Q9HC23 129 aa5.09□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 R4GN57 208 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 GGNQ86UU5 652 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 CD59P13987 128 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 EVI2AP22794 236 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 Q96M66 194 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GUT8 65 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 CXCL13O43927 109 aa5.07□□□□□ -1.6
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