RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU2AF1Q16633 256 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPRA1Q86W33 373 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM80Q96HE8 168 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPOQ9BU64 300 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCH11A6NNE9 402 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F6UB75 175 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EBAG9O00559 213 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFNGO00587 321 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNAPC5O75971 98 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRASP01116 189 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTXN2P0C2S0 81 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GADD45AP24522 165 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSG9Q00887 426 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF114Q8NC26 417 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRN1Q9NPD7 142 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIVA1O15304 175 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTHLHP12272 177 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AZU1P20160 251 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G6PCP35575 357 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RORCP51449 518 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CATR1Q13166 79 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM78BQ5VT40 261 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZS49 121 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB22AQ9UL26 194 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IRGMA1A4Y4 181 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTN1P15515 57 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M6PRP20645 277 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FXYD4P59646 89 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIGITQ495A1 244 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINK9Q5DT21 86 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HES5Q5TA89 166 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFE4Q86UQ8 179 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CADM3Q8N126 398 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYL12BO14950 172 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD1AP06126 327 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 8.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF2P09038 288 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCGR2CP31995 323 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAX9P55771 341 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNGT1P63211 74 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLANAQ16655 118 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNIH2Q6PI25 160 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COQ8AQ8NI60 647 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM203Q969S6 136 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRNDQ9UKY0 176 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 U3KQE9 123 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNXBP22105 4242 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA5P20719 270 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DTYMKP23919 212 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPAR6P43657 344 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNT4P56705 351 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF79Q15937 498 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD1Q96SE0 405 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COMMD9Q9P000 198 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R2Z0 102 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLN5O75503 358 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NXPH4O95158 308 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCER2P06734 321 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCHL1P09936 223 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDNFQ49AH0 187 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM17Q86X19 198 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms