RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	CXCL3	P19876	107 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	TAS2R19	P59542	299 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	KCTD9	Q7L273	389 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198		Q8NAQ8	132 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4S2	Q8NH73	311 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	C11orf94	C9JXX5	98 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	UPK2	O00526	184 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	CTSG	P08311	255 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	NAT1	P18440	290 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	WT1-AS	Q06250	92 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	MEF2D	Q14814	521 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	POU2AF1	Q16633	256 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	LILRB2	Q8N423	598 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4A5	Q8NH83	315 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	MUC4	Q99102	2169 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	C15orf61	A6NNL5	157 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198		K7EIM0	57 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	SSNA1	O43805	119 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	HRAS	P01112	189 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	CTXN2	P0C2S0	81 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	M6PR	P20645	277 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	DTYMK	P23919	212 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	HLA-DMB	P28068	263 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	HTR2B	P41595	481 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	CDNF	Q49AH0	187 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	OR10C1	Q96KK4	312 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP6V0B	Q99437	205 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	SSX5	O60225	188 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	B3GALNT1	O75752	331 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	SERPINE2	P07093	398 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	TFPI2	P48307	235 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM187	Q14656	261 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	ARL6IP1	Q15041	203 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198		Q6ZTC4	211 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	PRRT1	Q99946	306 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	THYN1	Q9P016	225 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198		X6R8D5	127 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A0B4J2A0	478 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198		M0R2N4	97 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	TNFSF12	O43508	249 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	FGF2	P09038	288 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	OR13C7	P0DN81	318 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC25A4	P12235	298 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	PTHLH	P12272	177 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	CBX5	P45973	191 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	TAS2R31	P59538	309 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	FGL1	Q08830	312 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	MSMO1	Q15800	293 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM4B-208	ENST00000534198	C12orf74	Q32Q52	190 aa		6.26	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms