RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GUS0 222 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00862A6NCI5 91 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 C15orf62A8K5M9 175 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 NDUFA3O95167 84 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 NDUFA7O95182 113 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 APELAP0DMC3 54 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 DEFA4P12838 97 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 AANATQ16613 207 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8N6K4 173 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF709Q8N972 641 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01006Q8NI28 216 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 SUN5Q8TC36 379 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF747Q9BV97 191 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN18-208ENST00000520837 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 CYB5BO43169 146 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 REG1AP05451 166 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 ARL16Q0P5N6 197 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 RAB31Q13636 194 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 STPG2Q8N412 459 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 PIFOQ8TCI5 191 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 TMED6Q8WW62 240 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 ARPC1AQ92747 370 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 GGACTQ9BVM4 153 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 PLXNB1O43157 2135 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 NOTCH1P46531 2555 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 A6NDX4 124 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 M0QZK8 103 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 TSPAN4O14817 238 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 PRH1P02810 166 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 AREGP15514 252 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 FGF7P21781 194 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 CX3CL1P78423 397 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 DLK1P80370 383 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 AKR1C1Q04828 323 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 WT1-ASQ06250 92 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 C2orf83Q53S99 150 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 MISP3Q96FF7 219 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC35E1Q96K37 410 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 GINS3Q9BRX5 216 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 PARP11Q9NR21 331 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 E7EUB6 86 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 F8W735 103 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 HLA-DRB1P01911 266 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 FBLN7Q53RD9 439 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 CLLU1Q5K131 121 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 BTNL8Q6UX41 500 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8N9W7 124 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 OR1P1Q8NH06 330 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 P2RX4Q99571 388 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 ARV1Q9H2C2 271 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 C16orf95Q9H693 158 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GW64 132 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 CGB1A6NKQ9 187 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 TEX22C9J3V5 150 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN18-208ENST00000520837 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms