RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EP13	123 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL25	O15444	150 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FABP6	P51161	128 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TAS2R45	P59539	299 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	BATF	Q16520	125 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	STUM	Q69YW2	141 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZN92	141 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MUC15	Q8N387	334 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746		J3QR06	171 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	OVOL3	O00110	214 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PEX7	O00628	323 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TCF21	O43680	179 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	OR7C2	O60412	319 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SPINK4	O60575	86 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CD59	P13987	128 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2G1	P62253	170 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	RBX1	P62877	108 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC35B1	P78383	322 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	CD69	Q07108	199 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TNXA	Q16473	311 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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