RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	PF4V1	P10720	104 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RAB37	Q96AX2	223 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	COQ2	Q96H96	371 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf92	Q96LL3	132 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PROK2	Q9HC23	129 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MYOD1	P15172	320 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CD24	P25063	80 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TIMP3	P35625	211 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF585B	Q52M93	769 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CD177	Q8N6Q3	437 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CYYR1	Q96J86	154 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	NRN1	Q9NPD7	142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GW64	132 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SNAI2	O43623	268 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CD33	P20138	364 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CD69	Q07108	199 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TCF24	Q7RTU0	167 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01551	Q86U37	167 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	NOTCH2	Q04721	2471 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	DPF1	Q92782	380 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MLNR	O43193	412 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R60	P59551	318 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	GPR82	Q96P67	336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	KLK15	Q9H2R5	256 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ANOS1	P23352	680 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	GCSH	P23434	173 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PRCD	Q00LT1	54 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	METTL26	Q96S19	204 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GUT8	65 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE10	A6NGK3	116 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-33	P01593	117 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-33	P01594	117 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZS49	121 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C18orf15	Q96N68	181 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRE2	83 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CX3CL1	P78423	397 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	COTL1	Q14019	142 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TEX45	Q8NA69	505 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MGST2	Q99735	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		Q9H3A6	140 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		K7ERU9	68 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MDS2	Q8NDY4	140 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FOXH1	O75593	365 aa		6.65	□□□□□ -1.34

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