RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 CD27P26842 260 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OCC1Q8TAD7 63 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 CFHR1Q03591 330 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 C3AR1Q16581 482 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 C10orf128Q5T292 105 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 PIGCQ92535 297 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 C1RLQ9NZP8 487 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.73□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 GTSF1Q8WW33 167 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LRRC30A6NM36 301 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LMO7DNF2Z398 122 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SMIM13P0DJ93 91 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00694P0DN24 101 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.72□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1B0GWB2 263 aa9.72□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 RAB9BQ9NP90 201 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 PRSS12P56730 875 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 GAGE13Q4V321 117 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LILRA5A6NI73 299 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OR9G9P0C7N8 305 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SP9P0CG40 484 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 ATP5G3P48201 142 aa9.71□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM126AQ9H061 195 aa9.71□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 APCSP02743 223 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 THBDP07204 575 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 VWC2Q2TAL6 325 aa9.71□□□□□ -0.86
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SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 NABP1Q96AH0 204 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 PRO0461Q9UI25 63 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 DOCK7Q96N67 2140 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 SRD5A1P18405 259 aa9.7□□□□□ -0.86
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SH3BP2-217ENST00000510204 SSX8Q7RTT4 187 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 TRIB1Q96RU8 372 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 HSPB6O14558 160 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1-5P01602 117 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 PSG5Q15238 335 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.7□□□□□ -0.86
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SH3BP2-217ENST00000510204 CX3CL1P78423 397 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 TEPPQ6URK8 271 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 K7EN84 100 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 HLA-DQA1P01909 254 aa9.69□□□□□ -0.86
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SH3BP2-217ENST00000510204 NFE4Q86UQ8 179 aa9.69□□□□□ -0.86
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SH3BP2-217ENST00000510204 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 TNFSF11O14788 317 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1-39P01597 117 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1D-39P04432 117 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM27BQ5VT28 67 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.69□□□□□ -0.86
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