RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ENY2Q9NPA8 101 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 C15orf61A6NNL5 157 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TOX4O94842 621 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 IGLV2-8P01709 118 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FABP6P51161 128 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 PLEKHA3Q9HB20 300 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FZR1Q9UM11 496 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 M0R2Z0 102 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ACP7Q6ZNF0 438 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 Q6ZR03 302 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 OR4S2Q8NH73 311 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 S1PR3Q99500 378 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ZZEF1O43149 2961 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 CACNA1AO00555 2505 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 C15orf65H3BRN8 121 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FOXH1O75593 365 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SMIM21Q3B7S5 101 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TMEM140Q9NV12 185 aa13.55□□□□□ -0.24
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SYP-208ENST00000494396 C16orf97H3BN30 126 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 IGLL1P15814 213 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 VAMP3Q15836 100 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 RND1Q92730 232 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 MBD6Q96DN6 1003 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 NABP2Q9BQ15 211 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 JKAMPQ9P055 326 aa13.55□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 C2orf70A6NJV1 201 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 HLA-DRB1P01911 266 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SLAQ13239 276 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TNXAQ16473 311 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ZNF826PQ6ZT77 177 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ZNF596Q8TC21 504 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SMIM12Q96EX1 92 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 RAB9BQ9NP90 201 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SSTR5P35346 364 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FXYD3Q14802 87 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 CR1LQ2VPA4 569 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TNFRSF19Q9NS68 423 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.54□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SPINK4O60575 86 aa13.53□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.53□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.53□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 GGTLC3B5MD39 225 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 M0R1X1 148 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 WNT9BO14905 357 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 GLRXP35754 106 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 TCL1AP56279 114 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 Q56UQ5 140 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 WDR82Q6UXN9 313 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 Q8TCH9 128 aa13.52□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 OR7C2O60412 319 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 PROP1O75360 226 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 C8orf88P0DMB2 117 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 IGFBP2P18065 325 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 MZT1Q08AG7 82 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 POU2AF1Q16633 256 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 SSX8Q7RTT4 187 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 DEFB125Q8N687 156 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.52□□□□□ -0.25
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SYP-208ENST00000494396 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 GNG12Q9UBI6 72 aa13.52□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 CADP27708 2225 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 OR5AL1P0C617 328 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 SLC35B1P78383 322 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 MSMPQ1L6U9 139 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 LCN12Q6JVE5 192 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 DUSP13Q9UII6 198 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 PRNDQ9UKY0 176 aa13.51□□□□□ -0.25
SYP-208ENST00000494396 K7ERU9 68 aa13.51□□□□□ -0.25
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