RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489789.3

CNTNAP3B-209, Transcript of contactin associated protein like 3B, human

TSL 5

Gene CNTNAP3B, Length 501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CYB5B	O43169	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KCNAB3	O43448	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PROP1	O75360	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ACTL6B	O94805	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KBTBD11	O94819	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MT-CO2	P00403	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IFNA4	P05014	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CD1B	P29016	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SNCA	P37840	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A0A1W2PPI3	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		F8W036	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NXPH3	O95157	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CD5	P06127	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PF4V1	P10720	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FGF7	P21781	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OPRK1	P41145	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CFHR4	Q92496	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	P2RX4	Q99571	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		G3V4G9	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		M0QZK8	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	APOC3	P02656	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PF4	P02776	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	AMY1A	P04745	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FABP1	P07148	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PSMB3	P49720	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DEFA5	Q01523	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RHEB	Q15382	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	GUK1	Q16774	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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