RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 GLYATQ6IB77 296 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 RAB12Q6IQ22 244 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 REG3GQ6UW15 175 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 STX19Q8N4C7 294 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 OR10H4Q8NGA5 316 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 GALMQ96C23 342 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 PELI1Q96FA3 418 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 IL4I1Q96RQ9 567 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 PEX16Q9Y5Y5 336 aa2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 MCRIP1C9JLW8 97 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 H3BMM0 161 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 H3BN98 237 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SIVA1O15304 175 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PRKYO43930 277 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SC5DO75845 299 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CRYZL1O95825 349 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 NAPSAO96009 420 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ISG15P05161 165 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CTSGP08311 255 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CD3GP09693 182 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF735P0CB33 412 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CEACAM6P40199 344 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CDK5Q00535 292 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 NXNL2Q5VZ03 156 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 Q8N814 137 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR6M1Q8NGM8 313 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PYURFQ96I23 114 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GPER1Q99527 375 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SPIN2AQ99865 258 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 BANF2Q9H503 90 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 MGAT4AQ9UM21 535 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SPATA2Q9UM82 520 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa2.77□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ST8SIA3O43173 380 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ATP8B1O43520 1251 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CLN5O75503 358 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GPX5O75715 221 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CCNKO75909 580 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 YIF1AO95070 293 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RLN1P04808 185 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 FABP3P05413 133 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 KRT8P05787 483 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GSTT2P0CG29 244 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GSTT2BP0CG30 244 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PAFAH1B2P68402 229 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF85Q03923 595 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR5I1Q13606 314 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ATP6AP1Q15904 470 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 MPV17LQ2QL34 196 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 VMA21Q3ZAQ7 101 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PSMG4Q5JS54 123 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TMEM244Q5VVB8 128 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PET117Q6UWS5 81 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HACD2Q6Y1H2 254 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 Q6ZRU5 148 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 UBAC2Q8NBM4 344 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 BEST4Q8NFU0 473 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DCANP1Q8TF63 244 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR10C1Q96KK4 312 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CXorf58Q96LI9 332 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TMEM109Q9BVC6 243 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 METTL9Q9H1A3 318 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 VSIRQ9H7M9 311 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 S100A14Q9HCY8 104 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms