RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERCC6Q03468 1493 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R378 163 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV3-7P01780 117 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIPP30301 263 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF137PP52743 207 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS24P62847 133 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FLOT2Q14254 428 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYPL2Q5VXT5 272 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf99Q6UWK7 81 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 AHSA2Q719I0 299 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF676Q8N7Q3 588 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLPP5Q8NEB5 264 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM12Q96EX1 92 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRELID1Q9Y255 219 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HS3ST2Q9Y278 367 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.72□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYLKQ15746 1914 aa-0.72□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa-0.72□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIA2Q96PC5 1412 aa-0.72□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGPD5Q99666 1765 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 METTL15A6NJ78 407 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SGCEO43556 437 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CST4P01036 141 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASAH2BP0C7U1 165 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 STAG3L2P0CL84 134 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 F8A1P23610 371 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD40LGP29965 261 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB31Q13636 194 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNA13Q14344 377 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf137Q5JT78 98 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 XKRXQ6PP77 449 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCN15Q6UWW0 184 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSX8Q7RTT4 187 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA24Q86W54 205 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC6Q86X45 466 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR52K2Q8NGK3 314 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB2BQ8WUD1 216 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MITD1Q8WV92 249 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD7Q92527 254 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CATSPER2Q96P56 530 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PARVAQ9NVD7 372 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASL12Q9NYN1 266 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.73□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHD1O14646 1710 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAST2Q6P0Q8 1798 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX7A2LO14548 114 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNAP29O95721 258 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00614P0C842 121 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FGF6P10767 208 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADORA1P30542 326 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAAOP46952 286 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLX6P56179 175 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHOGP84095 191 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXN5Q5MJ07 72 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q5VV11 94 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZQT0 140 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 AAED1Q7RTV5 226 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 STOML3Q8TAV4 291 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM56Q96MV1 263 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIXL1Q9H2W2 232 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACER3Q9NUN7 267 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP45Q9UL16 551 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PP64 1363 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PXDNQ92626 1479 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.74□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms