RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SPACA5Q96QH8 159 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM126AQ9H061 195 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FGF22Q9HCT0 170 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CACNG5Q9UF02 275 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 H3BMG7 143 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 K7EN84 100 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-7P01780 117 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 APOA2P02652 100 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ATP5G3P48201 142 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FABP6P51161 128 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PSG7Q13046 419 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LY6DQ14210 128 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OTPQ5XKR4 325 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 RHBDD2Q6NTF9 364 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 DTX2Q86UW9 622 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 BORCS8Q96FH0 119 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 THYN1Q9P016 225 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.89□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PRD5 423 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PRE2 83 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PRF3 423 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PRM7 423 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OOEPA6NGQ2 149 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 VWC2LB2RUY7 222 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PATE3B3GLJ2 98 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 M0QXV9 152 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 P0C879 139 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FGF6P10767 208 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GCHFRP30047 84 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CSN1S1P47710 185 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 HERV-K104P63124 156 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 C10orf128Q5T292 105 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 RNF144BQ7Z419 303 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 DTX1Q86Y01 620 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ATOH7Q8N100 152 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SPTSSAQ969W0 71 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 WDR54Q9H977 334 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ARID1AO14497 2285 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.88□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A087X0K7 114 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GW15 77 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GXF2 115 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 E9PLD3 99 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LINC01619G3V211 115 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 H0YGG7 62 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZIC3O60481 467 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 SRD5A1P18405 259 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF1AP19438 455 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R45P59539 299 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ERVK11-1P61568 191 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 C5orf47Q569G3 176 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 Q8N7P7 452 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GATSQ8NAP1 163 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LRRC29Q8WV35 223 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.87□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 NAT6Q93015 286 aa5.87□□□□□ -1.47
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