RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 PITPNAQ00169 270 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SPIN4Q56A73 249 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CASP12Q6UXS9 341 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 BLNKQ8WV28 456 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MUCL1Q96DR8 90 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 FOPNLQ96NB1 174 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 C12orf57Q99622 126 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 C16orf95Q9H693 158 aa3.67□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 NAGKQ9UJ70 344 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 OR51F1A6NGY5 319 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 C4orf51C9J302 202 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 F8W036 122 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 TP53I11O14683 189 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SOCS1O15524 211 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF16O43320 207 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SSNA1O43805 119 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 GADD45GO95257 159 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV3-15P01624 115 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV3-11P04433 115 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A1P30531 599 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 WNT4P56705 351 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM11AP58511 58 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SELENOWP63302 87 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MADCAM1Q13477 382 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PMVKQ15126 192 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00471Q8N535 108 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2T4Q8NH00 348 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 YIPF5Q969M3 257 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM210BQ96KR6 192 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.66□□□□□ -1.82
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STRADBP1-201ENST00000478954 MED11Q9P086 117 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.66□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MUC2Q02817 5179 aa3.65□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5H1A6NKK0 313 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PDCD5O14737 125 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 HPGDSO60760 199 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ENTPD6O75354 484 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ORM1P02763 201 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 MT-ND4P03905 459 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 RLN2P04090 185 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TCRBP04435 133 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 S100A8P05109 93 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPOP30536 169 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB13P51153 203 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 BAXQ07812 192 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 MDP1Q86V88 176 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 LFNGQ8NES3 379 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF799Q96GE5 643 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM56Q96MV1 263 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SPACA5Q96QH8 159 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.65□□□□□ -1.83
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