RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 C21orf140B9A014 251 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 PLAUP00749 431 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 CD46P15529 392 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 LOXL3P58215 753 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 MBD6Q96DN6 1003 aa14.55□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 ZNF137PP52743 207 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 GABRA6Q16445 453 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 RHOGP84095 191 aa14.54□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 IGHV1-2P23083 117 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 DDB2Q92466 427 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 J3QR06 171 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 TNFSF15O95150 251 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 C8orf88P0DMB2 117 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 PSG9Q00887 426 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SPRNQ5BIV9 151 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 ZNF576Q9H609 170 aa14.53□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 FAM201AQ5SY85 155 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 OR4S2Q8NH73 311 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SSX8Q7RTT4 187 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 SVIPQ8NHG7 77 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 PRR7Q8TB68 274 aa14.52□□□□□ -0.08
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PRE2 83 aa14.52□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.52□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.52□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 IGKV1-16P04430 117 aa14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 TAS2R45P59539 299 aa14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 OR2V2Q96R30 315 aa14.51□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 TCTAP57738 103 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 DEFB125Q8N687 156 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 SARAFQ96BY9 339 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 PLXNB1O43157 2135 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 MEOX1P50221 254 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 JPT1Q9UK76 154 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 ABCA1O95477 2261 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 GAGE12BA1L429 117 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 H3BTX0 84 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 J3QW42 95 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 LEPROTL1O95214 131 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 ZNF329Q86UD4 541 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 PEX7O00628 323 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 CSN3P07498 182 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 BLNKQ8WV28 456 aa14.49□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 ST20Q9HBF5 79 aa14.48□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.48□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 OR2J3O76001 311 aa14.48□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 CALYQ9NYX4 217 aa14.48□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.48□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 RND1Q92730 232 aa14.47□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.47□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 UQCRFS1P47985 274 aa14.47□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.47□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PREB-208ENST00000468045 GTSF1Q8WW33 167 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms