RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 NHLH2Q02577 135 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CD300CQ08708 224 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2F1Q13607 317 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 AWAT1Q58HT5 328 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSM6Q6P461 480 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 LILRB2Q8N423 598 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TXN2Q99757 166 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ATRQ13535 2644 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0D9SG52 128 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 DFFBO76075 338 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL16Q0P5N6 197 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF345Q14585 488 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4X1Q8NH49 305 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 SMCO3A2RU48 225 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF222A6NCQ9 220 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TAAR5O14804 337 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG7O60262 68 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CLN5O75503 358 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CD28P10747 220 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 C4BPBP20851 252 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 RND2P52198 227 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 RIPPLY3P57055 190 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 AKR1C1Q04828 323 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 GAMTQ14353 236 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CLINT1Q14677 625 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 MLANAQ16655 118 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 Q56UQ5 140 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 NPIPB3Q92617 1050 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ACY3Q96HD9 319 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5SQ99766 215 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CUBNO60494 3623 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT19A8MXV4 375 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNA5P01569 189 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-11P01762 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-48P01763 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-23P01764 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC3BP05452 202 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 FABP1P07148 127 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 RUNX1Q01196 453 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFA5Q01523 94 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB31Q13636 194 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF266Q14584 549 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 VWC2Q2TAL6 325 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXL17Q9UF56 701 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-208ENST00000462602 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2T8A6NH00 312 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFP92A6NM28 416 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 MPDU1O75352 247 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.251e-6■■□□□ 12.5
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL2P19875 107 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10J1P30954 320 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 TEPPQ6URK8 271 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 TREML4Q6UXN2 200 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-208ENST00000462602 TMUB2Q71RG4 321 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms