RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHG4P01861 327 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 ELANEP08246 267 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 SFTA3P0C7M3 94 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXE3Q13461 319 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM219AQ8IW50 185 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 SFT2D2O95562 160 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV1-5P01602 117 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 OPN1MWP04001 364 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R1AQ13522 171 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4A16Q8NH70 328 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 MED6O75586 246 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV1-40P01703 118 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 P0C879 139 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRNA7P36544 502 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 AARDQ4LEZ3 155 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF152Q8N8N0 203 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 TMED6Q8WW62 240 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR2B8PP59922 312 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFRSF9Q07011 255 aa8.28□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.28□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 AQP10Q96PS8 301 aa8.28□□□□□ -1.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 SULT1A2P50226 295 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGEF1-205ENST00000450873 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.27□□□□□ -1.09
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