RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARPC1AQ92747 370 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF580Q9UK33 172 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCL2P10415 239 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ICAM4Q14773 271 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHEBQ15382 184 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACSM6Q6P461 480 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 THAP8Q8NA92 274 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5R1Q8NH85 324 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC35E1Q96K37 410 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TUBA4BQ9H853 241 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MANBALQ9NQG1 85 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 THYN1Q9P016 225 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 VAX2Q9UIW0 290 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 I3L2K1 104 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGF1P05019 195 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 AREGP15514 252 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSMB3P49720 205 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNB1P62873 340 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4X1Q8NH49 305 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP6V0BQ99437 205 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MGST2Q99735 147 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 VSIRQ9H7M9 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MED13LQ71F56 2210 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMCO3A2RU48 225 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMY1AP04745 511 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFA4P12838 97 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IER3P46695 156 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MFAP2P55001 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBLN7Q53RD9 439 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6YL49 198 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB24Q969Q5 203 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRGV9Q99603 122 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TXN2Q99757 166 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 RARRES2Q99969 163 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 B4DEV8 164 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM250H0YL14 139 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHG2P01859 326 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00869P0C866 280 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPBWR1P48145 328 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MLANAQ16655 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAGHQ16775 308 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCN15Q6UWW0 184 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF2Q99496 336 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM160Q9NX00 188 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNG13Q9P2W3 67 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087WWC5 75 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms