RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442691.6

NR1I3-211, Transcript of nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NR1I3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 UQCC3Q6UW78 93 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TXN2Q99757 166 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.17□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 POLQO75417 2590 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM89A2RUT3 159 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 I3L2K1 104 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TSPAN15O95858 294 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 DEFA4P12838 97 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 CAMLGP49069 296 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 NDPQ00604 133 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 RUNX1Q01196 453 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 FBLN7Q53RD9 439 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 FAM209BQ5JX69 171 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 OR4X1Q8NH49 305 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TRGV9Q99603 122 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 RSG1Q9BU20 258 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 PDZD2O15018 2839 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 SMCO3A2RU48 225 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 FAM223BA6NKX1 122 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 AP4M1O00189 453 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 AGPAT2O15120 278 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 ATP6V0E1O15342 81 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 PRH1P02810 166 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 AMY1AP04745 511 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 S100A1P23297 94 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 PAX6P26367 422 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 NPBWR1P48145 328 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 MFAP2P55001 183 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 Q6ZRG5 221 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 S100A7AQ86SG5 101 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 CXorf58Q96LI9 332 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 RNF2Q99496 336 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 MGST2Q99735 147 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.15□□□□□ -1.26
NR1I3-211ENST00000442691 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.15□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 CLDN34H7C241 214 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 K7EIM0 57 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 MT-CO2P00403 227 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 TNCP24821 2201 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 PPT1P50897 306 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 PLP1P60201 277 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 B2MP61769 119 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 TM4SF20Q53R12 229 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 NECAP1Q8NC96 275 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 MARC2Q969Z3 335 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 PFDN5Q99471 154 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 RPRMQ9NS64 109 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 ATP6V1G1O75348 118 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 CLN5O75503 358 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV4-59P01825 116 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 REG1AP05451 166 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 RND2P52198 227 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 MFAP4P55083 255 aa7.13□□□□□ -1.27
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF616Q08AN1 781 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms