RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 AGPAT2O15120 278 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CRLF1O75462 422 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PPT1P50897 306 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PEA15Q15121 130 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR5R1Q8NH85 324 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PIFOQ8TCI5 191 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FAM210AQ96ND0 272 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RNF2Q99496 336 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MGST2Q99735 147 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SSX3Q99909 188 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 A6NDX4 124 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 HAX1O00165 279 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 BRI3O95415 125 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 AVPP01185 164 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FABP1P07148 127 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 DEFA4P12838 97 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 AREGP15514 252 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CD24P25063 80 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PRR20EP86478 221 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PRR20CP86479 221 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PRR20DP86480 221 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PRR20BP86481 221 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PRR20AP86496 221 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV9Q99603 122 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF580Q9UK33 172 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPV4 95 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 I3L521 148 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB2A1O75556 95 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MT-CO2P00403 227 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 IFNA1P01562 189 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CD5P06127 495 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ZP3P21754 424 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FHITP49789 147 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 B2MP61769 119 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ACSM6Q6P461 480 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR4X1Q8NH49 305 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MISP3Q96FF7 219 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ATP6V0BQ99437 205 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TXN2Q99757 166 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 H3BUA1 57 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 I3L2K1 104 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 REG1AP05451 166 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 NPBWR1P48145 328 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PSMB3P49720 205 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MFAP2P55001 183 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RHOBP62745 196 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 STPG3Q8N7X2 389 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 SUN5Q8TC36 379 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 NPIPB3Q92617 1050 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 PFDN5Q99471 154 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 RFNGQ9Y644 331 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TNCP24821 2201 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM218A2RU14 115 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP92A6NM28 416 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 H3BUX3 64 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1A-202ENST00000409024 YIF1AO95070 293 aa7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms