RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
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ODC1-202ENST00000405333 SLC35E1Q96K37 410 aa15.79■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
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ODC1-202ENST00000405333 C15orf32Q32M92 178 aa15.72■□□□□ 0.11
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF329Q86UD4 541 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 OR4X1Q8NH49 305 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.71■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
ODC1-202ENST00000405333 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-202ENST00000405333 TSPAN15O95858 294 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-202ENST00000405333 IGLC1P0CG04 106 aa15.7■□□□□ 0.1
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