RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM147Q9BVK8 224 aa23.08■■□□□ 1.29
ECHS1-201ENST00000368547 CLLU1Q5K131 121 aa23.08■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A10Q96PG2 267 aa23.08■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A32Q9H2D1 315 aa23.08■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 SPP1P10451 314 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 PF4V1P10720 104 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 PSMB8P28062 276 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RAB14P61106 215 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 LCNL1Q6ZST4 164 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF114Q8NC26 417 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 P2RX4Q99571 388 aa23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 IFNA4P05014 189 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.284e-8■■□□□ 13.5
ECHS1-201ENST00000368547 FOXE3Q13461 319 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA5Q16718 116 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD1Q8N668 190 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 TMED6Q8WW62 240 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 KLK15Q9H2R5 256 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 UQCC1Q9NVA1 299 aa23.06■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 DLK1P80370 383 aa23.05■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 OR4X2Q8NGF9 303 aa23.05■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC20Q8TCA0 184 aa23.05■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 WFDC12Q8WWY7 111 aa23.05■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 FNDC10F2Z333 226 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 H3BUA1 57 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 ELANEP08246 267 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf44Q8N8P7 122 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 DMRT1Q9Y5R6 373 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 MFAP2P55001 183 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 KRTAP10-3P60369 221 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 OR1P1Q8NH06 330 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 SCGB1C1Q8TD33 95 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 FANCD2OSQ96PS1 177 aa23.04■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 TRGV3P03979 118 aa23.03■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RAB9AP51151 201 aa23.03■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 PVRIGQ6DKI7 326 aa23.03■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A24Q6NUK1 477 aa23.03■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RNF141Q8WVD5 230 aa23.03■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 TENM1Q9UKZ4 2725 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 BRI3O95415 125 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 CD28P10747 220 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V0CP27449 155 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 TPPP2P59282 170 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 DEFA5Q01523 94 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RNF152Q8N8N0 203 aa23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa23.01■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa23.01■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 OR1L6Q8NGR2 347 aa23.01■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 OR2J3O76001 311 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 NMBP08949 121 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 FAM74A1Q5RGS3 127 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 CYB5BO43169 146 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 SULT1A2P50226 295 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 RHOGP84095 191 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 KLK9Q2XQG4 91 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 KLK9Q9UKQ9 250 aa23■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL7Q9UJT9 491 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 TIMM9Q9Y5J7 89 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 MPDU1O75352 247 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 RAB5CP51148 216 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 NECAP1Q8NC96 275 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 CACNG8Q8WXS5 425 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 MISP3Q96FF7 219 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 SH3BGRL3Q9H299 93 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 WDR83OSQ9Y284 106 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 MYOZ3Q8TDC0 251 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 MDFIQ99750 246 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 THYN1Q9P016 225 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 COL6A5A8TX70 2615 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 UMAD1C9J7I0 102 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 CORTO00230 105 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFB8O95169 186 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf54Q6X4T0 127 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 NPVFQ9HCQ7 196 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 FAM223BA6NKX1 122 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 RUNX1Q01196 453 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 CD69Q07108 199 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 FAM223AQ8IWN6 122 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 OR2G3Q8NGZ4 309 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHS1-201ENST00000368547 SERF2P84101 59 aa22.95■■□□□ 1.26
ECHS1-201ENST00000368547 C15orf32Q32M92 178 aa22.95■■□□□ 1.26
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