RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM42Q69YG0 159 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 RNF125Q96EQ8 232 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 PRCDQ00LT1 54 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ZIC3O60481 467 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C18orf12Q96KH6 178 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0G2JK05 382 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GTI1 187 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 UPK2O00526 184 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 DYSFO75923 2080 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 REG1AP05451 166 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 CCL20P78556 96 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 OVOL1O14753 267 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 CBLN1P23435 193 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ICAM4Q14773 271 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 RRHO14718 337 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SIGLEC5O15389 551 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MALP21145 153 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM238C9JI98 176 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 THBDP07204 575 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ST20Q9HBF5 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 CRPP02741 224 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM86BQ8N661 226 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 OSTCQ9NRP0 149 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 CGB1A6NKQ9 187 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 M0R381 172 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 GPR183P32249 361 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 EMP1P54849 157 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 USMG5Q96IX5 58 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 EPOPA6NHQ4 379 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 HBDP02042 147 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SLC17A3O00476 420 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 PLAURQ03405 335 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM160Q9NX00 188 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 PSMB11A5LHX3 300 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 LY6EQ16553 131 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 LINC01587Q99440 93 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 MESP2Q0VG99 397 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF688P0C7X2 276 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 GATA3P23771 443 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 IGFBP2P18065 325 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C9JCJ5 164 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV1-2P23083 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 FBXL15Q9H469 300 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf30Q96GV9 206 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 HIVEP2P31629 2446 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.03□□□□□ -1.6
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