RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 BTCP35070 178 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 TSPAN7P41732 249 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM258P61165 79 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 TEX45Q8NA69 505 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SORL1Q92673 2214 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 FAM166AQ6J272 317 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF205O95201 554 aa6.97□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 FGF11Q92914 225 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.97□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.96□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SPINT1O43278 529 aa6.96□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 PATE4P0C8F1 98 aa6.96□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 C16orf97H3BN30 126 aa6.96□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 M0R381 172 aa6.96□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.96□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 TFPI2P48307 235 aa6.96□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 LEPROTO15243 131 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 GP6Q9HCN6 339 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 LHX9Q9NQ69 397 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 LDLRAD4O15165 306 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV2-70P01814 119 aa6.96□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PPV9 198 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 H3BMM0 161 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 REG1BP48304 166 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 UBE2WQ96B02 151 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 REG4Q9BYZ8 158 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 PIN1P1O15428 100 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 VWC2LB2RUY7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF688P0C7X2 276 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 UCN2Q96RP3 112 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 PSG1P11464 419 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 SPINK14Q6IE38 97 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 MSGN1A6NI15 193 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MALP21145 153 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MESP2Q0VG99 397 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 UTF1Q5T230 341 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 CDKN1BP46527 198 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 C3AR1Q16581 482 aa6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 RNF126Q9BV68 326 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.94□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MAGEA5P43359 124 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 C9orf118A6NHY6 69 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 COL9A1P20849 921 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GWJ7 208 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFC2O95298 119 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 NPIPB3Q92617 1050 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 TOMM40O96008 361 aa6.94□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MUC21Q5SSG8 566 aa6.94□□□□□ -1.3
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