RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PRR32B1ATL7 298 aa18.58■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A0A6YYD4 124 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 RNF222A6NCQ9 220 aa18.58■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 RBMY1CP0DJD4 496 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 PSMG4Q5JS54 123 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT10Q8NFP7 164 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 SLC50A1Q9BRV3 221 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 TYMSP04818 313 aa18.57■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa18.56■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 ADMP35318 185 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A28Q96A46 364 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 LYPD3O95274 346 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 TRAV41A0A0B4J266 112 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV21A0A0B4J279 112 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GW15 77 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 DUTP33316 252 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 DMRT1Q9Y5R6 373 aa18.53■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 NEUROG1Q92886 237 aa18.53■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM200BQ69YZ2 307 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 PRCDQ00LT1 54 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 PRR31Q5SQ13 230 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf55Q5SWW7 151 aa18.53■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 GGNQ86UU5 652 aa18.52■□□□□ 0.56
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PTPRM-201ENST00000332175 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF815PA8K554 130 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 FXYD7P58549 80 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 ERVK11-1P61568 191 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0U1RRA0 63 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 EFNA2O43921 213 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CD28P10747 220 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00518Q8N0U6 118 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00614P0C842 121 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 VSIRQ9H7M9 311 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SERF1AO75920 110 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 OR9G4Q8NGQ1 327 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB121Q5J5C9 76 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 Q0VFX4 171 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 C1QL4Q86Z23 238 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CHCHD5Q9BSY4 110 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 RIPPLY3P57055 190 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 EFNB3Q15768 340 aa18.5■□□□□ 0.55
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