RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPRK1P41145 380 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPBWR1P48145 328 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 INPP1P49441 399 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R1AQ13522 171 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMCO1Q147U7 214 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB125Q8N687 156 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10C1Q96KK4 312 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCHY1Q96PM5 261 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA4BQ9H853 241 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFT2D2O95562 160 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF9Q07011 255 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLANAQ16655 118 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf83Q53S99 150 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRTM2Q8N967 370 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 YIF1AO95070 293 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFB6O95139 128 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM50AO95807 157 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL7P13232 177 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTCP35070 178 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAGHQ16775 308 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMPXQ9UHP9 88 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GU03 582 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR11H12B2RN74 326 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN4O14817 238 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLN5O75503 358 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPY1RP25929 384 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4X1Q8NH49 305 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBKSQ9H477 322 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMAT4Q9H898 229 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHEK1O14757 476 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PITX3O75364 302 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1S1Q8NH92 325 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTD1Q8TEA8 209 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF2Q99496 336 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 GINS3Q9BRX5 216 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-17P01599 117 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA25Q9BR10 227 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf170A2RU37 121 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA10P01566 189 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A4P12235 298 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A6P12236 298 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RND2P52198 227 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIGITQ495A1 244 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 U3KQ87 197 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPXA8MT69 81 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLC1P0CG04 106 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOXA1Q86UR1 476 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CITED4Q96RK1 184 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C46A6NHA9 309 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G10O15496 165 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCGB2A1O75556 95 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXB5P09067 269 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST8SIA2Q92186 375 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms