RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CD69Q07108 199 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SPANXN5Q5MJ07 72 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS46E5RG02 174 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PPP5D1E7EU14 171 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 L7N2F9 121 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TGOLN2O43493 480 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 DEDDO75618 318 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ARL3P36405 182 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 NPBWR1P48145 328 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SLURP1P55000 103 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 VAMP2P63027 116 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MLANAQ16655 118 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SPSB3Q6PJ21 355 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR4X1Q8NH49 305 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ASB13Q8WXK3 278 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-48P01763 117 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ADMP35318 185 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RPEL1Q2QD12 228 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 Q56UQ5 140 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ACSM6Q6P461 480 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS54Q6PEW0 395 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TREML4Q6UXN2 200 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZNX1 250 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR2T8A6NH00 312 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 H0YIZ8 118 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 GNG7O60262 68 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CLN5O75503 358 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 MPC2O95563 127 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 RLN2P04090 185 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CTSGP08311 255 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 PET100P0DJ07 73 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 GPHB5Q86YW7 130 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 DCUN1D4Q92564 292 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 E5RGE8 158 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 METTL15P1P0C7V9 234 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CD33P20138 364 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 RND2P52198 227 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 C1QL4Q86Z23 238 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.14□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 LGALS9O00182 355 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OVOL1O14753 267 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CCNKO75909 580 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR2C1O95371 312 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IGLC1P0CG04 106 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY1P47900 373 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CAV2P51636 162 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 GAMTQ14353 236 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 REC114Q7Z4M0 266 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF414Q96IQ9 312 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35E1Q96K37 410 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 RNF126Q9BV68 326 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.13□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 FAM24AA6NFZ4 105 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 FNDC10F2Z333 226 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SCGB2A1O75556 95 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 LYL1P12980 280 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 BCAP31P51572 246 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SYNJ2BPP57105 145 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 RAP2BP61225 183 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 DLK1P80370 383 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR8G2PQ6IF36 304 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR10P1Q8NGE3 313 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 NPIPB3Q92617 1050 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms