RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 RAB1CQ92928 201 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TBX15Q96SF7 602 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFA2O43678 99 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TCTAP57738 103 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TPPP2P59282 170 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 LY6DQ14210 128 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS8Q16651 343 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ATOH7Q8N100 152 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CDKN1AP38936 164 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 MUC21Q5SSG8 566 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 Q8TCH9 128 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 C11orf1Q9H5F2 150 aa10.26□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 LOXL3P58215 753 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 IQCJQ1A5X6 159 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 HLA-DRB5Q30154 266 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PRNTQ86SH4 94 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 GNG7O60262 68 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GW64 132 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 STAG3L2P0CL84 134 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 STAG3L3P0CL85 134 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CNTFRP26992 372 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ECSCRQ19T08 205 aa10.25□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 J3KRW8 73 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 HYPMO75409 117 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM144Q7Z5S9 345 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 HCFC1P51610 2035 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SRIP30626 198 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM178BH3BS89 294 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 COL8A1P27658 744 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PPOXP50336 477 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PRCDQ00LT1 54 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.24□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 E7EQL1 145 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 KLRD1Q13241 179 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TBR1Q16650 682 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM186Q96B77 213 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 F2RL2O00254 374 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 AREGP15514 252 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TCF15Q12870 199 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CT45A10P0DMU9 189 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CD69Q07108 199 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PERPQ96FX8 193 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 DIRC2Q96SL1 478 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 VAMP8Q9BV40 100 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 AMBPP02760 352 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ADMP35318 185 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TEX38Q6PEX7 206 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS33Q8NF86 280 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.23□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 MC5RP33032 325 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 POLQO75417 2590 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 CGB1A6NKQ9 187 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 NPPCP23582 126 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 DDTP30046 118 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 DYSFO75923 2080 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 VENTXO95231 258 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 LCN2P80188 198 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.22□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa10.21□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.21□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 P01737 135 aa10.21□□□□□ -0.77
UBXN4-201ENST00000272638 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms