RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A28Q96A46 364 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 KNTC1P50748 2209 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 CKS1BP61024 79 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 CDKN1AP38936 164 aa15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 HBDP02042 147 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 COLCA1Q6ZS62 124 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 OCC1Q8TAD7 63 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 OR9G9P0C7N8 305 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SRD5A1P18405 259 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 NPC2P61916 151 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 LINC00114Q6XXX2 140 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ANAPC13Q9BS18 74 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 LTBRP36941 435 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 C7orf69Q9H7B7 122 aa15□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 H0YIZ8 118 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 NBR2O15453 112 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 NAPSAO96009 420 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 FOXL1Q12952 345 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 A0A0A6YYD4 124 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 GZMBP10144 247 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 FAM168AQ92567 244 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.99□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 IGKCP01834 107 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 RNF125Q96EQ8 232 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 STHQ8IWL8 128 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 PSG8Q9UQ74 426 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 CD28P10747 220 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 MORN2Q502X0 79 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 RNF182Q8N6D2 247 aa14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 WBP1Q96G27 269 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 PRR32B1ATL7 298 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 C17orf100A8MU93 164 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 VWCEQ96DN2 955 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ASCL2Q99929 193 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 EFNB3Q15768 340 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A20O43772 301 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 CXCL1P09341 107 aa14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF883P0CG24 379 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 UBE2CO00762 179 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 LYNX1P0DP58 116 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 F8VVB4 439 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 F8VWA3 439 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 CD33P20138 364 aa14.96□□□□□ -0.01
COL5A3-201ENST00000264828 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 GP6Q9HCN6 339 aa14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 YPEL1O60688 119 aa14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 YPEL2Q96QA6 119 aa14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 OSTCQ9NRP0 149 aa14.96□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 IGLV3-19P01714 112 aa14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 PEMTQ9UBM1 199 aa14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.95□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 FXYD7P58549 80 aa14.94□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.94□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.94□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
COL5A3-201ENST00000264828 RHOGP84095 191 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms