RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 A8MWP6 167 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 CGB1A6NKQ9 187 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 PRSS2P07478 247 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV1-2P23083 117 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 ORAOV1Q8WV07 137 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 COPS9Q8WXC6 57 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 NCOR1O75376 2440 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 NPPCP23582 126 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 RNF144BQ7Z419 303 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 FOXC2Q99958 501 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 AKAP6Q13023 2319 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 TEX29Q8N6K0 151 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 DERL1Q9BUN8 251 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV2-5P01817 119 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 ASCL4Q6XD76 172 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 FAM216BQ8N7L0 139 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 HBDP02042 147 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF883P0CG24 379 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 HTN1P15515 57 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 GPX1P07203 203 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 ADIPOQQ15848 244 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 SAMD13Q5VXD3 122 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 OR2K2Q8NGT1 345 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PPBPP02775 128 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PRR19A6NJB7 356 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 CELA3BP08861 270 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 GNG5P63218 68 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 TDGF1P3P51864 188 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 HSD52Q0P140 79 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PLXNA3P51805 1871 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FBXL15Q9H469 300 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PYYP10082 97 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 TSPOP30536 169 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FAM181BA6NEQ2 426 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FOXF2Q12947 444 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 RLFQ13129 1914 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 C5orf63A6NC05 138 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 NUDT10Q8NFP7 164 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 OR9G4Q8NGQ1 327 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 NUDT11Q96G61 164 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 SCGB3A1Q96QR1 104 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 ROS1P08922 2347 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 B9A039 149 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PLAURQ03405 335 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FAM201AQ5SY85 155 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 DPM3Q9P2X0 92 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 LPAR2Q9HBW0 351 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 MPDZO75970 2070 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 C3orf79P0CE67 100 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 LINC01559Q495D7 138 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 ESPL1Q14674 2120 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 ATP5G2Q06055 141 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 MGST2Q99735 147 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 MEGF9Q9H1U4 602 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 PF4V1P10720 104 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 UBE2V1Q13404 147 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 GGNQ86UU5 652 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 TMPRSS3P57727 454 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 CFHR1Q03591 330 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXA13-201ENST00000222753 EREGO14944 169 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 PSG8Q9UQ74 426 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 POLEQ07864 2286 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 CRXO43186 299 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 COX6B1P14854 86 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 LEPP41159 167 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 Q0VG73 95 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXA13-201ENST00000222753 CSRP2Q16527 193 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms