RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637820.1

SPTAN1-236, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-236ENST00000637820 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1-236ENST00000637820 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1-236ENST00000637820 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1-236ENST00000637820 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.85□□□□□ -2.54
SPTAN1-236ENST00000637820 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.85□□□□□ -2.54
SPTAN1-236ENST00000637820 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.85□□□□□ -2.54
SPTAN1-236ENST00000637820 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 FER1L5A0AVI2 2057 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 SMIM26A0A096LP01 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 A0A1W2PPL8 197 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 OR6C65A6NJZ3 312 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 B4E171 279 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 FAM86B1E9PN63 330 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 H3BT86 120 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 H3BUA1 57 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 H7C0C1 242 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 H7C1C5 153 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 I3L4J1 428 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 M0QYV0 167 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 M0R381 172 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 PTGESO14684 152 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 PMM2O15305 246 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 MFSD11O43934 449 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 DCTN3O75935 186 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 OR2A4O95047 310 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 VAPBO95292 243 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 LYPLA2O95372 231 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 APOMO95445 188 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CST4P01036 141 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 GH1P01241 217 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 PPBPP02775 128 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RLN1P04808 185 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 MYL1P05976 194 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 ACYP1P07311 99 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 HBQ1P09105 142 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 FAM86B2P0C5J1 330 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 PIRTP0C851 137 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 SMIM18P0DKX4 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CT45A6P0DMU7 189 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CT45A5P0DMU8 189 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CT45A7P0DMV0 189 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CCDC192P0DO97 292 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 SPI1P17947 270 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 GGT1P19440 569 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 HLA-DPA1P20036 260 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 MX1P20591 662 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 SLC2A5P22732 501 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CXCR1P25024 350 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 KLRK1P26718 216 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 MAPK1P28482 360 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CA8P35219 290 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 ADD2P35612 726 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 LEPP41159 167 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 BDKRB1P46663 353 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CAPZBP47756 277 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 GNAQP50148 359 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 DLX6P56179 175 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RHBDL3P58872 404 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 UBE2G2P60604 165 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RAB2AP61019 212 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 LCN6P62502 163 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RAD51Q06609 339 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 C2orf80Q0P641 193 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CETN1Q12798 172 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 COX17Q14061 63 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RHEBQ15382 184 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 PPP2R5EQ16537 467 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 BCL7AQ4VC05 210 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 HIKESHIQ53FT3 197 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CLLU1OSQ5K130 101 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CTSL3PQ5NE16 218 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 CCDC183Q5T5S1 534 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 C1orf195Q5TG92 126 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 UBE2UQ5VVX9 321 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 DUPD1Q68J44 220 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 SFXN4Q6P4A7 337 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 TMCO3Q6UWJ1 677 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-236ENST00000637820 LRRN1Q6UXK5 716 aa-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms