RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 SIGMAR1Q99720 223 aa7.59□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 TMEM50AO95807 157 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 LYL1P12980 280 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 MMD2Q8IY49 270 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 UCNP55089 124 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 Q6ZS92 163 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 hADV38S2A0JD32 116 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 P01737 135 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 AMY1AP04745 511 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 TMEM56Q96MV1 263 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 HES4Q9HCC6 221 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 Q9UFV3 132 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 ZNF292O60281 2723 aa7.56□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 H3BVH4 76 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 K7N7A8 449 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 C1QTNF9P0C862 333 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 PLA2G5P39877 138 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 RELBQ01201 579 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 GAGE1Q13065 139 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 SPSB4Q96A44 273 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 IGKV1-5P01602 117 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 IGLV3-1P01715 115 aa7.56□□□□□ -1.2
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GGA3-222ENST00000621217 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 IMMP2LQ96T52 175 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 PLAUP00749 431 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 COL8A1P27658 744 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 KLRB1Q12918 225 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 WDR82Q6UXN9 313 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 MUC15Q8N387 334 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 PNKDQ8N490 385 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-222ENST00000621217 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.56□□□□□ -1.2
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