RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 K7EIM0 57 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 PFDN1O60925 122 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 PSMB8P28062 276 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 NHLH2Q02577 135 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 SLC25A24Q6NUK1 477 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF546Q86UE3 836 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 OR2J3O76001 311 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 CST7O76096 145 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP10-3P60369 221 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 RNF152Q8N8N0 203 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 MYOZ3Q8TDC0 251 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 AQP10Q96PS8 301 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 HMSDA8MTL9 139 aa16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 H3BUA1 57 aa16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 DEFA4P12838 97 aa16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 CXCL2P19875 107 aa16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 MISP3Q96FF7 219 aa16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 RNF114Q9Y508 228 aa16.27■□□□□ 0.2
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM89A2RUT3 159 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ARPC5O15511 151 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-48P01763 117 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 OR8U8P0C7N1 319 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 PF4V1P10720 104 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SULT1A1P50225 295 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RHOGP84095 191 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 FOXE3Q13461 319 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 GON7Q9BXV9 100 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 HSPB11Q9Y547 144 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 MT-CO2P00403 227 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 TRGV3P03979 118 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 IFNA4P05014 189 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RAB9AP51151 201 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 OR8G2PQ6IF36 304 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 NOXA1Q86UR1 476 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 OR1L6Q8NGR2 347 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 WFDC1Q9HC57 220 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 S4R3C0 116 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 F8W735 103 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ELANEP08246 267 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RAB11AP62491 216 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLC35B1P78383 322 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 CD69Q07108 199 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ZFP69Q49AA0 526 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 TEX38Q6PEX7 206 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 NECAP1Q8NC96 275 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLC25A31Q9H0C2 315 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 CD28P10747 220 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 TPPP2P59282 170 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SCARB1Q8WTV0 552 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 HYLS1Q96M11 299 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 MFFQ9GZY8 342 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 HAX1O00165 279 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLC38A11Q08AI6 406 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 C15orf32Q32M92 178 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 COMMD1Q8N668 190 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 FAM223BA6NKX1 122 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 CORTO00230 105 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-23P01764 117 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 OPRK1P41145 380 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 DLK1P80370 383 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 BAXQ07812 192 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 GAMTQ14353 236 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 VWC2Q2TAL6 325 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 C18orf65Q6ZTR6 163 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLC16A13Q7RTY0 426 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms