RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 Q96M66 194 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FAM166AQ6J272 317 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CISD3P0C7P0 127 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF708P17019 499 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 MPV17P39210 176 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 WNT2BQ93097 391 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 COX6B1P14854 86 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 UTF1Q5T230 341 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TRACP01848 142 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SCTP09683 121 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CRYBB3P26998 211 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 Q5PR19 223 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NRN1LQ496H8 165 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM54Q969K7 222 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 MED13Q9UHV7 2174 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 HIGD1CA8MV81 97 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 MLNRO43193 412 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 COQ2Q96H96 371 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 DSCR8Q96T75 97 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 KLK15Q9H2R5 256 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 H3BUT2 72 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SOCS3O14543 225 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 R4GN57 208 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF10Q5QP82 559 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL15Q9H469 300 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PATE4P0C8F1 98 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IFITM1P13164 125 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZS52 159 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 UPK3AO75631 287 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZP1P60852 638 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SPINK14Q6IE38 97 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NABP2Q9BQ15 211 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SSTR5P35346 364 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 OR9G1Q8NH87 305 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 AHRRA9YTQ3 701 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PDE6HQ13956 83 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ACYP1P07311 99 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SPRED2Q7Z698 418 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 B9A039 149 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 OR2H2O95918 312 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 OR9G9P0C7N8 305 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 STHQ8IWL8 128 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF721Q8TF20 911 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 F8W1H4 67 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 GP6Q9HCN6 339 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NRN1Q9NPD7 142 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 APELAP0DMC3 54 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 GZMBP10144 247 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CD28P10747 220 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM240Q5SV17 173 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 MOSP00540 346 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms