RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LIPFP07098 398 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR5G3P0C626 314 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AREGP15514 252 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HOXA5P20719 270 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRP14P37108 136 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RITA1Q96K30 269 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BKO60814 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BJP06899 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMIM6P0DI80 62 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BOP23527 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BBP33778 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA6P56556 154 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BDP58876 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BCP62807 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NECAP1Q8NC96 275 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DERL1Q9BUN8 251 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGF2RP11717 2491 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNCP24821 2201 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCO2A0A1W2PP80 73 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSG5Q15238 335 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRSS8Q16651 343 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNIP4Q6PIL6 250 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR5T1Q8NG75 326 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPEQ96AT9 228 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TPSG1Q9NRR2 321 aa15□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PPI3 338 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COX7A1P24310 79 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C11orf52Q96A22 123 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHODLQ9H9P2 273 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP5D1E7EU14 171 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRYGBP07316 175 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C8orf88P0DMB2 117 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BTF3L4Q96K17 158 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF5Q99942 180 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR7C2O60412 319 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRGC1P0CF51 173 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DLX1P56177 255 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SELENOTP62341 195 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNXAQ16473 311 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 THAP8Q8NA92 274 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPIPB3Q92617 1050 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FRZBQ92765 325 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IMMP2LQ96T52 175 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KALRNO60229 2985 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF114Q8NC26 417 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PFDN5Q99471 154 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SFRP2Q96HF1 295 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PPQ1 181 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LY6LH3BQJ8 138 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SOD3P08294 240 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C1QTNF9P0C862 333 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMB11A5LHX3 300 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C22orf46C9J442 243 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9JCJ5 164 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHOX2AO14813 284 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COX7A2P2O60397 106 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LY6HO94772 140 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 REG1AP05451 166 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNTFRP26992 372 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms