RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 RNF2Q99496 336 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 KLK11Q9UBX7 282 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 SMPXQ9UHP9 88 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-247ENST00000602698 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.09□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 AGRNO00468 2067 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 KMT2AQ03164 3969 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 A0A0J9YWU9 116 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 SPRY2O43597 315 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 GNG7O60262 68 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 YIF1AO95070 293 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 IGKV1-5P01602 117 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 IGHV3-48P01763 117 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 CD3DP04234 171 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 P0C879 139 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TBPP20226 339 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 BMI1P35226 326 aa7.08□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TNFRSF9Q07011 255 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 SPINK9Q5DT21 86 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 LYG2Q86SG7 212 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 GALNT14Q96FL9 552 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ST8SIA3O43173 380 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 AKR1C2P52895 323 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 PMS2P11Q13670 270 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 STPG3Q8N7X2 389 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 SLC35G3Q8N808 338 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 RNF183Q96D59 192 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ABHD1Q96SE0 405 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 GINS3Q9BRX5 216 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 A0A0B4J293 547 aa7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 ATG12O94817 140 aa7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 CD74P04233 296 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 TAS2R19P59542 299 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ZNF124Q15973 351 aa7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TERB2Q8NHR7 220 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 COPZ2Q9P299 210 aa7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 GABARAPH6UMI1 98 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 CORTO00230 105 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 RAB3DO95716 219 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 CD5P06127 495 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 SP6Q3SY56 376 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.05□□□□□ -1.28
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HCG18-247ENST00000602698 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 TCF24Q7RTU0 167 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 ST8SIA2Q92186 375 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 VSIRQ9H7M9 311 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-247ENST00000602698 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.05□□□□□ -1.28
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