RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592410.5

ERCC1-215, Transcript of ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit, human

TSL 2

Gene ERCC1, Length 508 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC1-215	ENST00000592410	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		A0A1W2PPR1	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		B4DEV8	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		M0R036	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TOX4	O94842	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	CXorf1	O96002	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MOS	P00540	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OPN1MW	P04001	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	CRYGB	P07316	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	BRS3	P32247	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TAS2R45	P59539	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	B2M	P61769	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SELENOT	P62341	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	ICAM4	Q14773	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TNXA	Q16473	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MGST2	Q99735	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		A0A1W2PPI3	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		C9JQL5	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		F6UZH7	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TSPAN4	O14817	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TIMM23	O14925	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	NBR2	O15453	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	PDE6D	O43924	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	VENTX	O95231	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	CNIH1	O95406	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	FABP1	P07148	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	FBP1	P09467	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	COX6B1	P14854	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MYOD1	P15172	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	UBE2E1	P51965	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	BPIFB3	P59826	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	CCL20	P78556	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	PAX2	Q02962	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	HES1	Q14469	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MMD	Q15546	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	NPB	Q8NG41	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	PFDN5	Q99471	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	RARRES2	Q99969	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410		A0A087WWC5	75 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ERCC1-215	ENST00000592410	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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