RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591955.1

NPC1-213, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 4

Gene NPC1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-213	ENST00000591955	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		A1L4Q6	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SAP30	O75446	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	WISP2	O76076	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ADH4	P08319	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		P0C879	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	FABP6	P51161	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	METAP1	P53582	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	HBB	P68871	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	GABRA6	Q16445	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TAL2	Q16559	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	NRTN	Q99748	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	MPDZ	O75970	2070 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ARID1A	O14497	2285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		A0A1B0GX78	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		A8MWL6	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	C21orf140	B9A014	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		K7EN84	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZIC3	O60481	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	CRYAA	P02489	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	S100A7	P31151	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SSTR5	P35346	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	CRYBA4	P53673	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	RAC3	P60763	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	AES	Q08117	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	KLRD1	Q13241	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TNXA	Q16473	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		Q6AWC8	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	GPR82	Q96P67	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	VGLL1	Q99990	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	MAST4	O15021	2626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-213	ENST00000591955		A0A1B0GXF2	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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