RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 THYN1Q9P016 225 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SPG11Q96JI7 2443 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0U1RQK1 487 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC16A13Q7RTY0 426 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CITED4Q96RK1 184 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 WNK2Q9Y3S1 2297 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 H2AFB1P0C5Y9 115 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CXorf58Q96LI9 332 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SSX3Q99909 188 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 RSG1Q9BU20 258 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PBDC1Q9BVG4 233 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CGB1A6NKQ9 187 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX22C9J3V5 150 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FABP1P07148 127 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CX3CL1P78423 397 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TREML4Q6UXN2 200 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N9W7 124 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5R1Q8NH85 324 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 HRH4Q9H3N8 390 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 NPIPB5A8MRT5 1133 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FCN1O00602 326 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MDKP21741 143 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FFAR4Q5NUL3 377 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MISP3Q96FF7 219 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MT-CO2P00403 227 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 M6PRP20645 277 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SELENOTP62341 195 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB2A2Q13296 93 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM120AOSQ5T036 256 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PVRIGQ6DKI7 326 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SPNS3Q6ZMD2 512 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf139Q6ZV77 190 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 C19orf24Q9BVV8 132 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 E7EUB6 86 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL29P47914 159 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ELLP55199 621 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A9Q9NUM3 307 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA1P01562 189 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 REG1AP05451 166 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYGCP07315 174 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 AREGP15514 252 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CTRB1P17538 263 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PAX6P26367 422 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CTRB2Q6GPI1 263 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC9CQ8N5M4 171 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10G4Q8NGN3 311 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10G9Q8NGN4 311 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10G7Q8NGN6 311 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PPV4 95 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD2BA6NFX1 497 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 KRBOX1C9JBD0 128 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BUX3 64 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 AGPAT2O15120 278 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 GAMTQ14353 236 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf56Q8N8D9 126 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 LYPD6BQ8NI32 183 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ACY3Q96HD9 319 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF2Q99496 336 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 WNT10AQ9GZT5 417 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PXMP4Q9Y6I8 212 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GW64 132 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 HNF1AP20823 631 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 B2MP61769 119 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PEA15Q15121 130 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SGMS2Q8NHU3 365 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SFT2D1Q8WV19 159 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GGTLC1Q9BX51 225 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SMDT1Q9H4I9 107 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 A6NDX4 124 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP92A6NM28 416 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PPT1P50897 306 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A7AQ86SG5 101 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 WFDC11Q8NEX6 87 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MBD3L1Q8WWY6 194 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MGST2Q99735 147 aa17.94■□□□□ 0.46
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