RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf61A6NNL5 157 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BMQ9 156 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CA1P00915 261 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-48P01763 117 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PMP2P02689 132 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MFAP4P55083 255 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD4CQ8TF44 421 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC10Q9UM13 185 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CTF1Q16619 201 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF24Q7RTU0 167 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTM3Q96MX0 182 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 XRCC3O43542 346 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-CO2P00403 227 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTM1Q8IZ96 169 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TXN2Q99757 166 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR31O00270 319 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LEMD1Q68G75 181 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5H2Q8NGV7 314 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ST8SIA2Q92186 375 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TSC22D3Q99576 134 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-211ENST00000590874 APOHP02749 345 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM187Q14656 261 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLDA2Q53GA4 152 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRB2Q8N423 598 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM24BQ8N5W8 94 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF114Q8NC26 417 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH6Q9C0G6 4158 aa18.69■□□□□ 0.58
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CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB131AP59861 70 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PAFAH1B2P68402 229 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM20LQ6UXN7 152 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A6AQ9H2W1 248 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 VSIRQ9H7M9 311 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 APLNQ9ULZ1 77 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG7O60262 68 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTAP57738 103 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R46P59540 309 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R20P59543 309 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PRCDQ00LT1 54 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8NAQ8 132 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6F1Q8NGZ6 308 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC22AQ96IW7 307 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLL5B9A064 214 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ST8SIA3O43173 380 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-39P01597 117 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-39P04432 117 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GINS3Q9BRX5 216 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 DFFBO76075 338 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 HRH1P35367 487 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFBR1P36897 503 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM69Q5SWH9 247 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D26Q86UD7 250 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LYSMD2Q8IV50 215 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4A16Q8NH70 328 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFAND3Q9H8U3 227 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM127O75204 238 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CD5P06127 495 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NCS1P62166 190 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2NLQ5JXB2 153 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DMAP28067 261 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 VBP1P61758 197 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINK9Q5DT21 86 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRFQ96AM1 343 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 HRH4Q9H3N8 390 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV2A0A0B4J234 112 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMY1CP0DJD4 496 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM3P62310 102 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL11P62913 178 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SPCS2Q15005 226 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GU03 582 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf94C9JXX5 98 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF600Q6ZNG1 722 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 STHQ8IWL8 128 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD12Q8N8I0 201 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RABAC1Q9UI14 185 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS3P35030 304 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ERHP84090 104 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP18Q8NEJ0 188 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DMBP28068 263 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 S100GP29377 79 aa18.6■□□□□ 0.57
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