RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569222.5

KIFC3-233, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 3

Gene KIFC3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-233	ENST00000569222	CSN3	P07498	182 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	VAMP1	P23763	118 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	ARL3	P36405	182 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	INPP1	P49441	399 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.22	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	TGOLN2	O43493	480 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	OR2C1	O95371	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	CLEC3B	P05452	202 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	ADM	P35318	185 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	DHRS2	Q13268	280 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-233	ENST00000569222	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.21	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222		A0A1B0GU03	582 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CENPX	A8MT69	81 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	SLC25A6	P12236	298 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	EDN2	P20800	178 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ASAH1	Q13510	395 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	MT-CO2	P00403	227 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	OR4E1	P0C645	316 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	SPN	P16150	400 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	IFITM3	Q01628	133 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	MISP3	Q96FF7	219 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	PRR25	Q96S07	402 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	UPK1B	O75841	260 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CTSG	P08311	255 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CORT	O00230	105 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	NXPH3	O95157	252 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	IGHV3-48	P01763	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	TCRB	P04435	133 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	SNCA	P37840	140 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	HTR2B	P41595	481 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	TXN2	Q99757	166 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	NUDT15	Q9NV35	164 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ADAP1	O75689	374 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	FOLR2	P14207	255 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	GP9	P14770	177 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	RBKS	Q9H477	322 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	NDUFA4	O00483	81 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	HOXB5	P09067	269 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-233	ENST00000569222	CBLN1	P23435	193 aa		10.15	□□□□□ -0.78

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