RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 F8W735 103 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 I3L2K1 104 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST8SIA3O43173 380 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFAP4P55083 255 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD81P60033 236 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 RELQ04864 619 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 GUCA2BQ16661 112 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD55Q3KP44 614 aa12.89□□□□□ -0.35
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CCNDBP1-211ENST00000567434 Q56UQ5 140 aa12.89□□□□□ -0.35
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RCHY1Q96PM5 261 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEURL2Q9BR09 285 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.89□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLXQ9UH92 298 aa12.89□□□□□ -0.35
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CCNDBP1-211ENST00000567434 EDN2P20800 178 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBAC2Q8NBM4 344 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52E5Q8NH55 327 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL22RA2Q969J5 263 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALNT14Q96FL9 552 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRDL1Q9BU40 450 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENY2Q9NPA8 101 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCUBQ9NWR8 336 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa12.88□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.87□□□□□ -0.35
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CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 C15orf62A8K5M9 175 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT-CO2P00403 227 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTSGP08311 255 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADMP35318 185 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 PYDC2Q56P42 97 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 PVRIGQ6DKI7 326 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTNL8Q6UX41 500 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 V9GYH0 126 aa12.87□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPBWR1P48145 328 aa12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPCS3P61009 180 aa12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM268Q5VZI3 342 aa12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM63Q969Q1 353 aa12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA25Q9BR10 227 aa12.86□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0G2JRQ6 117 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNG7O60262 68 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD7P09564 240 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ETV6P41212 452 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRPXP78539 464 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPINK9Q5DT21 86 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC190Q86UF4 302 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP18Q8NEJ0 188 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHFPL5Q8TAF8 219 aa12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR11H12B2RN74 326 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANXA3P12429 323 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM187Q14656 261 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAGHQ16775 308 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 BSXQ3C1V8 233 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZRM9 215 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM230Q96A57 120 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 C20orf24Q9BUV8 137 aa12.84□□□□□ -0.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN4O14817 238 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCGB2A1O75556 95 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 HTR2BP41595 481 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF79Q15937 498 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR146Q96CH1 333 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10C1Q96KK4 312 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNG5Q9UF02 275 aa12.83□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0B4J2A0 478 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 C3orf84H3BNL1 204 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SULT1A3P0DMM9 295 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SULT1A4P0DMN0 295 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKR1C4P17516 323 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB125Q8N687 156 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.82□□□□□ -0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
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