RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 PRKACBP22694 351 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 PAX6P26367 422 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 FLOT2Q14254 428 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GRK1Q15835 563 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 FAHD1Q6P587 224 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA24Q86W54 205 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RNF185Q96GF1 192 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CHST5Q9GZS9 411 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RAB26Q9ULW5 256 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 POMPQ9Y244 141 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 A6NIN4 97 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 G3V2T6 193 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 LY6LH3BQJ8 138 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 PLXNB1O43157 2135 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ISG15P05161 165 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CSN2P05814 226 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OCM2P0CE71 109 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CTRB1P17538 263 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 PRKACAP17612 351 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ATF1P18846 271 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RAB3BP20337 219 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CD34P28906 385 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MAS1LP35410 378 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2AP49459 152 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 DAPP51397 102 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 EDDM3AQ14507 147 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 C12orf73Q69YU5 71 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OSR2Q8N2R0 312 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CHST4Q8NCG5 386 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM230Q96A57 120 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 Q9H521 79 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HMG20AQ9NP66 347 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HHLA2Q9UM44 414 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 VWFP04275 2813 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 A6NDN8 102 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 K7EIL1 84 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 K7EMT4 169 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 DEGS1O15121 323 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ENTPD6O75354 484 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CA11O75493 328 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR2H2O95918 312 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GNAO1P09471 354 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR5H8P0DN80 308 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CDK2P24941 298 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MYCNOSP40205 109 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HERVK_113P61574 105 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35B1P78383 322 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MED21Q13503 144 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IZUMO2Q6UXV1 221 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TCF23Q7RTU1 214 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT14Q96FL9 552 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 B9D2Q9BPU9 175 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CHST6Q9GZX3 395 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms