RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TSPAN32Q96QS1 320 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SPACA1Q9HBV2 294 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 RASL12Q9NYN1 266 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 JPT1Q9UK76 154 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 UNC13CQ8NB66 2214 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 KCNK1O00180 336 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ACOX3O15254 700 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 IGLV3-1P01715 115 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PET100P0DJ07 73 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PSMB6P28072 239 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CASQ1P31415 396 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF137PP52743 207 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PSG9Q00887 426 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FABP9Q0Z7S8 132 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 STX5Q13190 355 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 GUK1Q16774 197 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SPANXN5Q5MJ07 72 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LPCAT4Q643R3 524 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TEX261Q6UWH6 196 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM156Q8N614 296 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB125Q8N687 156 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 KCTD7Q96MP8 289 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PRRT1Q99946 306 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DCSTAMPQ9H295 470 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OR51I2Q9H344 312 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CKLFQ9UBR5 152 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 U3KQ87 197 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MTUS2Q5JR59 1369 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.12□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DCCP43146 1447 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CACNA1HO95180 2353 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SBF1O95248 1867 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC160A6NGH7 325 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 M0R378 163 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FAAHO00519 579 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 UBL3O95164 117 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SPINK1P00995 79 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 BAALC-AS2P0C853 105 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CRYGAP11844 174 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 KCNE1P15382 129 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MAP2K4P45985 399 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 RHOGP84095 191 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CAV1Q03135 178 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 C6orf52Q5T4I8 152 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00575Q6W349 94 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 GPR32P1Q8NGA4 272 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OR4E2Q8NGC2 313 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SFT2D1Q8WV19 159 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 GINS4Q9BRT9 223 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DERL1Q9BUN8 251 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM147Q9BVK8 224 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FKBP14Q9NWM8 211 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TENM4Q6N022 2769 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ANK2Q01484 3957 aa-0.13□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZANQ9Y493 2812 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MYH10P35580 1976 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FANCMQ8IYD8 2048 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0D9SG52 128 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0J9YY10 115 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GX78 115 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CCL25O15444 150 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SULT1B1O43704 296 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PROSCO94903 275 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CD3DP04234 171 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 C8orf88P0DMB2 117 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SPI1P17947 270 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SPINT3P49223 89 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 QRFPP83859 136 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ANGPT1Q15389 498 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf137Q5JT78 98 aa-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms