RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559758.5

ETFA-209, Transcript of electron transfer flavoprotein subunit alpha, human

TSL 2

Gene ETFA, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETFA-209	ENST00000559758	GALM	Q96C23	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758		A0A1B0GUS0	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758		A6NDX4	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	SOCS3	O14543	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	SLC22A5	O76082	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	CRYBA1	P05813	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	RRAS	P10301	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	GP9	P14770	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	DTYMK	P23919	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF137P	P52743	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758		U3KQ87	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	ABCA1	O95477	2261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-209	ENST00000559758	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758		H3BUX3	64 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	TSC22D2	O75157	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	RAB3D	O95716	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CD74	P04233	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	FCGR3A	P08637	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	ZBTB25	P24278	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	IL3RA	P26951	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	RAB14	P61106	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	EBI3	Q14213	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	LTC4S	Q16873	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	UTF1	Q5T230	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	RPE	Q96AT9	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758		Q9HAA7	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	5e-6	■■■■■ 40.5
ETFA-209	ENST00000559758	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758		A0A0J9YWU9	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758		G3V3Q6	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758		L7N2F9	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	SCT	P09683	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	PTHLH	P12272	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	HLA-G	P17693	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	TBP	P20226	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CD1B	P29016	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CEACAM6	P40199	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-209	ENST00000559758	CBX5	P45973	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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