RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552433.1

LETMD1-233, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 727 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-233	ENST00000552433	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A087X0T9	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PMS2P2	O95744	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IFITM1	P13164	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CD1D	P15813	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CCL1	P22362	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CRYGS	P22914	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PSMB2	P49721	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RND2	P52198	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FOXA1	P55317	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PPP1CA	P62136	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	HES1	Q14469	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	MSMO1	Q15800	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC01587	Q99440	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A0D9SG52	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PGP	A6NDG6	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		H3BQ15	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	APOM	O95445	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FABP4	P15090	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	DRD3	P35462	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OPRK1	P41145	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM258	P61165	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6ZN92	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NPW	Q8N729	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NDUFS5	O43920	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	DEDD	O75618	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHG1	P01857	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CCL23	P55773	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CCL17	Q92583	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM100	Q9NV29	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	COL4A1	P02462	1669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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