RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PAX9P55771 341 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 NDPQ00604 133 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FOXE3Q13461 319 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR2F1Q13607 317 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 P2RX4Q99571 388 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GW64 132 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 H0YIZ8 118 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 MYOD1P15172 320 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 CFHR3Q02985 330 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SPINK9Q5DT21 86 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 RNF152Q8N8N0 203 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR5T1Q8NG75 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TXN2Q99757 166 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 MFFQ9GZY8 342 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 LINC01548A6NM66 108 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 C15orf62A8K5M9 175 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 G3V318 75 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ARPC5O15511 151 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SOX15O60248 233 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 MPDU1O75352 247 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TMEM50AO95807 157 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TRGV3P03979 118 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FABP1P07148 127 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OPRK1P41145 380 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 NPBWR1P48145 328 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 DLK1P80370 383 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ATP5G2Q06055 141 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 CD69Q07108 199 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 RAB31Q13636 194 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ZNF266Q14584 549 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 LILRB2Q8N423 598 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 LINC01006Q8NI28 216 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SLC35E1Q96K37 410 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 HSPB11Q9Y547 144 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.3□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 G3V3Q6 166 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 H3BP45 60 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 REG1AP05451 166 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PF4V1P10720 104 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PSMB8P28062 276 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 RAB9AP51151 201 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 MFAP4P55083 255 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 RHOGP84095 191 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 Q6ZS46 218 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 MISP3Q96FF7 219 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR4C12Q96R67 309 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 RNF114Q9Y508 228 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 JMJD1CQ15652 2540 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 IGSF23A1L1A6 192 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 JTBO76095 146 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 CST7O76096 145 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 MT-CO2P00403 227 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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