RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NUDT19A8MXV4 375 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GOSR1O95249 250 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CD5P06127 495 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMEM11P17152 192 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 DLK1P80370 383 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PEA15Q15121 130 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C2orf83Q53S99 150 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NPIPB3Q92617 1050 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C1orf159Q96HA4 380 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NDUFS8O00217 210 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR10J1P30954 320 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.335e-7■■■■□ 21.2
CS-215ENST00000549143 RAB31Q13636 194 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FXYD3Q14802 87 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 STPG3Q8N7X2 389 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 LFNGQ8NES3 379 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 S4R3C0 116 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NPFFO15130 113 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CRYGBP07316 175 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 AKR1C3P42330 323 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CD69Q07108 199 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMEM219Q86XT9 240 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GGACTQ9BVM4 153 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 DOK5Q9P104 306 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 VWC2LB2RUY7 222 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CYB5BO43169 146 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 YIF1AO95070 293 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 HBE1P02100 147 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MSMBP08118 114 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RND2P52198 227 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MFAP2P55001 183 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MALSU1Q96EH3 234 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SLC35E1Q96K37 410 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RNF223E7ERA6 249 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MPDU1O75352 247 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MBP02144 154 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 FAM106CPP0CH98 169 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 UBE2G2P60604 165 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CX3CL1P78423 397 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ZNF90Q03938 601 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SVBPQ8N300 66 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 J3QKU1 62 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TGFAP01135 160 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 PAX8Q06710 450 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 BSXQ3C1V8 233 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 COMMD1Q8N668 190 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 A0A0U1RQK1 487 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 BTBD17A6NE02 478 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TEX22C9J3V5 150 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 M0R036 132 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 AVPP01185 164 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 PLA2G2AP14555 144 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 BRS3P32247 399 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 NPBWR1P48145 328 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 FAM78BQ5VT40 261 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR5T1Q8NG75 326 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RNF5Q99942 180 aa6.7□□□□□ -1.34
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