RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ASIPP42127 132 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM8Q96KF7 97 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 GPHA2Q96T91 129 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 IGF2RP11717 2491 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SCGB1D1O95968 90 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C8orf88P0DMB2 117 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 RND3P61587 244 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C17orf98A8MV24 154 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 VAX2Q9UIW0 290 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 P2RY4P51582 365 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TWIST1Q15672 202 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C15orf32Q32M92 178 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 GBF1Q92538 1859 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 FAM223BA6NKX1 122 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 UPK2O00526 184 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 PAGE4O60829 102 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 CD74P04233 296 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SOD3P08294 240 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H3AP68431 136 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 OR51M1Q9H341 326 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 MPTX1A8MV57 137 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 MIC13Q5XKP0 118 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.49□□□□□ -1.05
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POLR1B-217ENST00000541869 KIR2DL4Q99706 377 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 WDR73Q6P4I2 378 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SEC11CQ9BY50 192 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TFF1P04155 84 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 PMCHP20382 165 aa8.49□□□□□ -1.05
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POLR1B-217ENST00000541869 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 A8MWL6 223 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SELLP14151 372 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 ATP6V0CP27449 155 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM187Q14656 261 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 COX19Q49B96 90 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 CFAP161Q6P656 301 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.49□□□□□ -1.05
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POLR1B-217ENST00000541869 ELANEP08246 267 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 OR5AL1P0C617 328 aa8.48□□□□□ -1.05
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POLR1B-217ENST00000541869 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 UQCC3Q6UW78 93 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 NRGNQ92686 78 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 RNF224P0DH78 156 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 MALP21145 153 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 NAT8Q9UHE5 227 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1B-217ENST00000541869 SPINK4O60575 86 aa8.48□□□□□ -1.05
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