RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537248.5

ZNF384-208, Transcript of zinc finger protein 384, human

TSL 2

Gene ZNF384, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF384-208	ENST00000537248	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	FAM210B	Q96KR6	192 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	GNG7	O60262	68 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	MT-CO2	P00403	227 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	GNG2	P59768	71 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	ERVK-16	P61578	105 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	RCN1	Q15293	331 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	DCANP1	Q8TF63	244 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM56	Q96MV1	263 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ZNF384-208	ENST00000537248	DBX1	A6NMT0	343 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	FXYD4	P59646	89 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ARPC4	P59998	168 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	CADM3	Q8N126	398 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	BEST4	Q8NFU0	473 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248		A0A1B0GU03	582 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	KRAS	P01116	189 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	RAB3B	P20337	219 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	SNAPC5	O75971	98 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	G6PC	P35575	357 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM17	Q86X19	198 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF114	Q8NC26	417 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	RAB40C	Q96S21	281 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	MGLL	Q99685	303 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	PRND	Q9UKY0	176 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	MYCBP2	O75592	4640 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	F2R	P25116	425 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	GNRHR	P30968	328 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	SCN3B	Q9NY72	215 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	RLN1	P04808	185 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	NPPC	P23582	126 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	MYL9	P24844	172 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	LPAR6	P43657	344 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	P2RY1	P47900	373 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	EMP1	P54849	157 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	NEU1	Q99519	415 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248		A0A1W2PS18	150 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	SMIM30	A4D0T7	59 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	SCGN	O76038	276 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	CRYBB3	P26998	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	C6orf223	Q8N319	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	MOB3A	Q96BX8	217 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	DUSP21	Q9H596	190 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	NPBWR1	P48145	328 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TPRA1	Q86W33	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	RGS10	O43665	173 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM50A	O95807	157 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	HTN3	P15516	51 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	PPP5C	P53041	499 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	METTL26	Q96S19	204 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	HELT	A6NFD8	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	FCER2	P06734	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	PRCD	Q00LT1	54 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	DHRS2	Q13268	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	BORCS5	Q969J3	196 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ZNF384-208	ENST00000537248	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms